Bažnyčios armija yra terminas, kuris gali būti naudojamas keliais skirtingais kontekstais, tačiau paprastai jis reiškia organizaciją ar judėjimą, susijusį su Katalikų Bažnyčia ar kita krikščionių denominacija, kuri skirta apginti Bažnyčios tikėjimą, mokymus arba kovoti už religinius tikslus.
Vienas iš žinomų pavyzdžių yra Salvation Army (liet. Išganymo armija), protestantiška organizacija, įkurta XIX amžiuje Anglijoje. Ši organizacija neturi tiesioginės sąsajos su kariuomene, tačiau ji vadinama armija dėl savo struktūros ir kovos už socialinę teisingumą ir moralines vertybes, remiantis krikščionišku tikėjimu. Išganymo armija garsėja labdaringa veikla ir parama vargstantiems, taip pat evangelizacija.
Katalikų Bažnyčios istorijoje „Bažnyčios armija“ gali būti siejama su laikotarpiais, kai Bažnyčia rėmė karinius judėjimus, siekdama ginti savo tikėjimą. Pavyzdžiui, Kryžiaus žygiai viduramžiais buvo karinės kampanijos, kurias Katalikų Bažnyčia organizavo siekdama susigrąžinti Šventąją Žemę iš musulmonų valdžios ir ginti krikščionybę.
Šiuolaikiniame kontekste terminas gali būti naudojamas metaforiškai, apibūdinant religines grupes ar bendruomenes, kurios aktyviai kovoja už savo tikėjimo apsaugą, moralinių vertybių palaikymą ar socialinę misiją.